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株式会社ポケモンより、ニンテンドーeショップで2012年7月14日配信開始のニンテンドー3DS専用ダウンロードソフト。価格は1,429円(税別)。販売元は任天堂、制作はクリーチャーズ。
ポケモンの詳細なデータを見たり、立体モデルを鑑賞できたりする「ポケモン立体図鑑BW」のパワーアップ版。「ポケモン立体図鑑BW」では一部のポケモンの情報しか閲覧できなかったが、「ポケモン全国図鑑Pro」では最初からシリーズすべてのポケモンを見ることができる。また、「ポケモン立体図鑑BW」にはなかった、さまざまな新機能が追加されている。
ARサーチャーでは、ARマーカーに映しだされたポケモンにタイプの玉を投げつけ、弱点かどうか調べることもできる。