リボソーム

たんぱく質の合成はリボソームで行われるという。 東京医科歯科大学教養部の講義資料（下記のpdf）がネットで拾えたので読んでいるが、詳しくはよくわからない。 https://www.tmd.ac.jp/artsci/biol/pdf3/Chapt9.pdf 普通、何かを生産する場合は、入力（材料、触媒）があり、あとは加工手順に従い、加工（切ったり、はったり）されて所望の出力が作成されていく。 自分のたんぱく質合成工程を簡単に書くと次のようになった。 ・転写 DNA遺伝情報 -> mRNAに転写（必要な設計図をコピー） 転写プロセスの触媒：RNAポリメラーゼ（酵素たんぱく質） ・たんぱく質合成（翻…

地球上に初めて生命が誕生したのは、約35億年前と言われています。 海中に存在した炭素に、海底火山の噴火に伴い噴出された重金属や硫黄などの 成分が火山の熱で化学反応を起こし、原始生命が誕生しました。 まだ今のような真核細胞ではなく、単細胞でしかありませんでしたが、 遺伝子を保存する核と、外界と区切るための細胞膜、タンパク質を代謝して 合成をおこなうリボソームがすでに備わっていました。 この3つがあることが生命とされる定義なのです。 やがて単細胞が集まって、より大きな真核細胞になり、魚類や爬虫類へと 進化を遂げてました。我々人間の体も例外ではなく、約60兆個の細胞でできています。 その細胞の寄り集…

ITSx (Bengtsson-Palme et al., 2013)は、ゲノムFastaファイルからITS配列を抽出するためのリファレンスベースのメソッドであるが、非常に時間がかかる。最近、リボソームRNA遺伝子を高速かつ正確に特定するBarrnapが開発された。この2つのソフトウェアを組み合わせて配列比較を行うことにより、このスクリプトは真菌ゲノムからのITS配列の高速抽出を可能にする。 インストール ubunutu20でpython3.6の環境を作ってテストした。 依存 Python 3.x Barrnap: https://github.com/tseemann/barrnap ITS…

【日曜コラム】危機管理と失敗 全体に公開・10時間前 危機管理：オープンさ、最新技術、科学コミュニケーション 新型コロナウイルスが出現した時、ウイルス配列の情報はすぐに世界中に共有され、それをもとに短期間の間にPCR検査やmRNAワクチンなどのワクチンが開発されました。人命にも関係した重要な情報は世界で共有して、問題の解決に利用していくというオープンな姿勢が求められると思います。 私は日本のバイオ系産業の経営、特に危機管理にも関わる課題として、最新技術を重視した体制作りや科学コミュニケーションを重視した対話に積極的でないということを感じています。おそらく上層部がバイオ系の最新知識や技術に精通し…

細菌マイクロバイオームの解析は日常的に行われるようになったが、真菌マイクロバイオームの解析は、頑健なデータベースとバイオインフォマティック・パイプラインの欠如によって、いまだに妨げられている。ここでは、真菌を同定するための分類学的データベース（160万個のマーカー遺伝子）と機能的データベース（340万個の非冗長真菌タンパク質）を組み込んだパイプライン、FunOMICを紹介する。このツールを2,600以上のヒトメタゲノムサンプルに適用したところ、地理、身体部位、疾患に関連する真菌種が明らかになった。相関ネットワーク解析により、菌界間相互作用に関する新たな知見が得られた。このパイプラインと2つの最…

【英単語】concentricを徹底解説！意味、使い方、例文、読み方concentricは【同心円と環は中心が同じ】という意味として使われています。 和訳：【同心】読み方はkənˈsen.trɪkです。豊富な例文及び運用法を通して「concentric」の意味を学びましょう!例文a concentric pattern同心円パターン例文A purely elastic instability apparently also occurs by a similar mechanism in other rotational shearing flows, namely concentric pl…

英語の授業を受けるのに困ったので、化学科の学部生が使いそうな英単語をまとめてみました。全部で1557語あります。おおもとの単語リストについては、福岡大学 機能生化研究室サイトの化学英単語を参考にしました。単語の追加、削除、内容の編集を行ったため、なにか問題がありましたらコメント欄かhttps://twitter.com/Dy66thまでお知らせください。 www.sc.fukuoka-u.ac.jp 5'→3' direction 5'→3'方向 ab initio 第一原理 ABS アクリロニトリル・ブタジエン・スチレン樹脂 absolute temperature 絶対温度 absorba…

はじめに 科学史を高い視点から俯瞰してみると、物理学と生物学は、20世紀の半ばまではほとんど何の目立った関係性をもたず、両者はほぼ「没交渉の関係」だったように見える。ところが、もう少し眼鏡の倍率を上げてよく見ると、1930年代に入ると、物理の側から生物に関心を持ち、物理学から生物学に転向する若い研究者が、ぽつぽつと現れるのが見えるようになる。この流れは時とともに勢いを増し、1940年代には物理学は生物学に急接近した。そして、生命現象の基底部に存在する遺伝子に狙いを定め、ついにはパクリと口を広げ、遺伝子を丸呑みにしてしまった。このような両者の邂逅（出会い）と衝突は、シュテファン・ツヴァイク流に言…

市場概要 NGSベースのRNAシーケンシング市場は、予測期間中（2024年～2031年）にCAGR 19.7%に達すると予測されています。NGSベースのRNAシーケンシングは、RNA配列内のヌクレオチドの順序を同定および決定する際に使用される技術です。 この技術は、トランスクリプトミクスおよび遺伝子発現の分析において重要な役割を果たしている。NGSベースのRNAシーケンシングは、サンプルから遺伝情報を得るための、より高速で信頼性の高い技術であり、スループット能力の大幅な向上により、これまでよりも低コストで実現します。 NGSベースのRNAシーケンス市場のダイナミクスと動向 NGSベースのRN…

市場概要 核酸検査市場レポートは、世界の市場規模、シェア、最新動向、競合情報、今後の市場展望などを分析しています。核酸検査は、様々な疾患の診断とモニタリングのための遺伝物質の検出と分析を含む。分子診断、感染症検査、遺伝子スクリーニングなどに広く利用されている。市場は、感染症の流行の増加、核酸検査技術の進歩、個別化医療への需要の高まりなどの要因によって牽引されている。核酸検査市場はアジア太平洋地域で著しい成長を遂げている。同市場の主要プレーヤーには、Roche Diagnostics、Abbott Laboratories、Thermo Fisher Scientific Inc.などがある。…

次世代シーケンサー（NGS）の世界市場は2022年に69億米ドルに達し、2031年には289億米ドルに達するなど、有利な成長が予測されています。世界の次世代シーケンサー（NGS）市場は、予測期間2024〜2031年に20.4％のCAGRを示すと予測されています。次世代シーケンシング（NGS）市場の動向は、アプリケーションの増加と研究開発の増加により、次世代シーケンシング（NGS）の製品発売が増加していることを示しています。 NGSでのシーケンスには、いくつかの重要なプロセスが含まれます。例えば、DNA次世代シーケンシング（NGS）には、ライブラリー調製、バイオインフォマティクス解析、DNA断片…

スレイヤーズ Blu-rayBOX 【完全生産限定版】 林原めぐみ Amazon 12月14日の視聴 ・『【夜ドラ】藤子・F・不二雄SF短編ドラマ「どことなくなんとなく」』 →なんていうかあれだな。ちょっとだけ『猿の惑星』チック。難しい話だと思う人もいるだろ ◇ ・『【夜ドラ】藤子・F・不二雄SF短編ドラマ「イヤなイヤなイヤな奴」（前編）』 →まっすー…なかなかイヤな奴やん。さて、誰がホントに“イヤな奴”なのやら。 →盗聴してるやん。やはり強いのは情報戦で勝てる者、か。 →まんまと乗るなよ…。 →ワハハ、コンプリートしてやがる。 →食べた！？ →なにこの殴りのコント。 ◇ ・『【夜ドラ】藤子・…