エタ沈

水に溶けたDNAを目に見える形に抽出する手法・エタノール沈殿について、ポイントは塩と酒（アルコール）を加えるという点にあるわけですが、そこで使う物質は結構色々なものがあります…なんてことをここ何回かの記事で見ており…… とはいえ前回の記事では、「使われることのない物質」として、一応アルコールの出発化合物といえる（炭素1つから成るアルコールなので）メタノールなんかを挙げて、 「毒性はもちろん、比誘電率が高いので、電気の偏りをなくすのが目的のアルコール沈殿では、効果の弱い雑魚であり使われることがないのでしょう」 なんてことに触れていました。 誘電率について、前回ももうちょい触れようと思っていたけれ…

ザ・細かすぎて面白くないエタ沈シリーズを続けていますが、ネタ不足・時間不足に悩む日々が続いているため、使えそうなものは使っていこうの貧乏性精神のもと、細かすぎるネタを続けさせていただきましょう。 「水に溶けたDNAを、目に見える白いカタマリにして沈めてやる」というエタ沈ですが、大まかな原理としては塩析と呼ばれるものであり、DNA水溶液に塩を加えて水への溶けやすさを減らしてやり、更にそこに追い打ちをかけるようにアルコールを加えることでDNAを析出する……という話だったわけですが、ここで使われる塩にはいくつか種類があります…なんてことをここ数回の記事で見ていました。 まぁ前回グラフなんかも見ていた…

ここ何回かの記事では、水に溶けているDNAを目に見えるカタマリとして沈殿させる手法・エタノール沈殿（通称エタ沈）について見ている感じです。 まぁ今さらですけど、エタ沈ってのは何のためにやられるのかと言いますと、これは別にDNAを可視化して「これがDNAなんだよ、凄いっしょ？」とかマウントを取るためなどではなく、簡単に言えば「精製と濃縮」を意図したものだといえましょう。 例えば細胞を1ミリリットルの溶液に溶かして、そこから染色体DNAを取り出した場合、得られたDNAは1ミリリットルという（分子生物学レベルでは）結構な量の液体に溶けた状態で存在している形になるわけですが… 実験によってはそんな大き…

前回の記事から久々に途中保留状態だったネタに戻っており、生命科学実験で汎用されるDNA精製手法「フェノクロ・エタ沈」の補足という、物理学的な小ネタよりよっぽど面白くも何ともない話をしていました。 とはいえ、何気に僕自身も知らなかった話が目に付いたので、備忘録も兼ねて細かすぎるエタ沈ネタを続けさせていただきましょう。 前回のラストで、羊土社による「核酸実験法」の解説記事を引用していたわけですが… www.yodosha.co.jp …エタ沈というのは、水に溶けているDNAを固体として目に見える沈殿として析出してやる手法なわけですけど、これは塩析と呼ばれる、結局分子レベルの電気的な力を上手いこと使…

それでは前回やや途中状態で終わってしまっていた「鳥かごの中の鳥の重さ」問題について、もうちょい気になる点を深追いしていこうかと思います。 「秤の上に置いた密閉した箱の中に、鳥が一羽、地面の上で羽根を休めている。 この鳥が地面（箱の底面）から飛び立って空中で完全に静止していたら、秤が示す重さはどうなるだろう？」 という有名な問いかけで、これは一瞬、 「そりゃあ鳥の分減るんじゃないの？だって鳥は箱から離れて浮いてるんだから、重さがかかるわけなくない？ …あれ、でもそうすると、鳥の重さはこの世のどこに消えたことになるんだ…？？」 みたいに思えるわけですが、この考え方は根本から間違っていまして、鳥が浮…

フェノクロ・エタ沈といった生命科学系実験でよく使われる遠心機の話から脱線した「回転・遠心」の話を終え、また途中状態だった所へ戻っていこうと思っていたのですが…… 例によって時間不足から来るネタ不足は慢性的なものであり、何か簡単に見れる脱線ネタはもうちょいないかな、と悪あがきで「遠心」について検索してみました所、以前気圧やら水圧やらといった圧力の話のときにお世話になりました、「わかりやすい高校物理の部屋」がまたまたトップにヒットしてきました（↓）。 ちょっとでもネタが増えてくれればありがたいことこの上ないので、今回はこちらからネタを捻り出させていただこうかな、と思います。 wakariyasui…

まず訂正から入りたいのですが、前々回の記事で見ていた回転アトラクション「トンデミーナ」でかかる遠心力（G）について、大きなミスを見つけてしまいました。 前回の記事を書いた時点でも気付かずそのまま「重力の13倍以上！」と書いてしまっていたものの、再読しているときに「いや待てよ、13Gって、そこまでかかるか…？！」と思い冷静に計算式を見直してみたら、トンデミーナのアームの長さは25メートルと公式に掲載されていたわけですけれども、ぬわぁんと！ 普通に考えて、これはアームの全長であり、中心の軸から左に12.5メートル、右に12.5メートル伸びていると考えるのが当然でしたから、遠心力を考える上で必要な「…

前回の記事では、遠心機のローターには大きく分けて2種類、アングルローターとスイングローターというものがあり、機械的にはアングルローターの方が高速回転させるのも当然余裕ではあるものの（全てが固定されている安定した物体なので）、実験の都合で、「超遠心」と呼ばれるクソ速回転で走らせる遠心分離は、接合部が存在して構造的には不安定なはずのスイングローターで行われることもままあるのです…… …的な話から、「超高速回転可能な遠心機、現在の世界ナンバーワンはどんなマシーンでどんなスピードなんだろう？」と疑問に思って調べた結果、日本の企業であるhimac社が開発したCS150NXというマシーンが、衝撃の15万r…

前回の記事では、遠心機・チューブバランス問題として、一般的にどういう状況なら釣り合いの取れた形で遠心機を回すことができるのか？…という点に、ちょうど入りかけた所で終わっていました。 例えば24穴（ウェル）ローターの場合、1本あるいは23本を配置することは不可能ですがそれ以外の全ての本数でバランスが取れる一方、10ウェルローターなんかの場合（まぁそんな中途半端なローターはまずないと思いますけど(笑)）、これもまぁ偶数穴だけあってそこそこの本数はカバーしているものの（バランス配置可能なのは2, 4, 5, 6, 8, 10本でした）、2と5を組み合わせて出来そうな「7本」をバランスよく配置すること…

前回、「バランスは取れているの…？」というタイトルの記事にしていましたが、これは実は今回触れるネタの方がより適切な感じで、チビタンの話ではバランスが取れてるか不明な感じなんてなかったのに、そこまで話が届かなかった（でもタイトルはもうつけていて変える暇もなかった）、って形でした。 （※全体を書き終えた後の追記：結局今回もその話には到達しませんでした(笑)。逆に、次回がそのネタになる感じですね。） まぁあまりにもどうでもいい点なので気にせずそのまま進めますと、チビタン（卓上小型簡易遠心機）のローターは6穴（6ウェル）が便利で、8ウェルローターの場合、3本回したいときに同じ重さのチューブを別途用意し…

前回の記事では遠心機の話に脱線していましたが、予告通り、今回もまた遠心機に関してちょっとした小ネタを挟んでみようかと思います。 ちょうどその話に持っていくのに都合が良いので、前回紹介していたチビタンから再開してみますと、小型卓上遠心機であるチビタンの特徴というか設計として、 「1.5 mLのエッペンチューブを6本入れられる『ローター』がついていることが多いですけど（8本とかのこともありますが）…」 …などということを書いていました。 前回のモノタロウのページでは実物の画像（ローターの様子）が分かりにくかったので、もっと分かりやすく写っている、よくあるタイプのチビタンの画像を借りつつ話を広げてみ…